1. 外观的区别： 从外观上来看，普洱生茶常呈暗绿色，随着储藏时间的增加，颜色会从嫩绿逐渐变化为嫩黄、杏黄、暗黄、黄褐、红褐。而普洱熟茶的叶底颜色一般呈“猪肝色”，并且随着储藏年数的增加，颜色也会逐渐转化为暗褐色。如果将普洱生茶和熟茶混合，会影响储藏茶叶的价值，散落的茶叶会互相混杂在一起。
2. 香气类型不同： 普洱生茶和熟茶的香气类型也不同。普洱生茶通常呈毫香、荷香、清香、栗香，而普洱熟茶则常呈参香、豆香、陈香、枣香、樟香等。由于香气类型不同，如果将生茶和熟茶混合储藏，香气物质必然会相互掩盖或改变，难以获得纯正自然的香气。
3. 制作过程的区别： 普洱茶在制作过程中有一道关键工序，叫做渥堆。在这个过程中，普洱茶会产生很多人体有益的微生物，如黑曲酶、纤维素酶、果胶分解酶等。这些微生物使得普洱茶在口感上变得甘滑醇厚。未经过渥堆处理的晒青毛茶制成品被称为普洱生茶，而经过人工发酵加工的普洱茶则被称为普洱熟茶。
4. 功效方面的区别： 普洱生茶和熟茶都具有许多保健功效。普洱生茶主要可以清理肠道，降脂，提神，降压，帮助减肥等，适合年轻人群。但由于较多活性成份，易引发失眠、感冒发热、胃溃疡及孕妇等身体不适者不宜饮用。普洱熟茶可以防癌、抗癌、降脂、降压、预防动脉硬化、预防便秘、利尿、养胃、抗衰老等，较适合中老年人群及胃寒等人群。