1、茶叶的原料区别：正山小种和金骏眉都是采自同一种茶树，但采摘的茶叶部位不同。正山小种采用的是茶树嫩芽一芽一叶或一芽两叶，而金骏眉必须选自茶树刚开芽的嫩叶，摘取芽头最鲜嫩的部位。
2、制作工艺区别：正山小种和金骏眉制作工艺类似，但微小的改进使金骏眉的制作工艺更精进。金骏眉的发酵和熏制过程与正山小种不同。
3、口感区别：正山小种带有浓郁的松烟味和桂圆香气，而经过处理的金骏眉口感清淡香醇，相比正山小种的松烟味更轻。
4、外观区别：金骏眉的外观细长，呈金、黄、黑三色交错，主要是黑色，带有金色的毫尖，同时具有果香和花香，冲泡后的色泽为金黄色；而正山小种的外观紧密匀称，为黑褐色且油润，冲泡后的色泽为橙黄色明亮，比金骏眉更浓。