同仁堂陈皮丝和新会陈皮都是以陈皮为原料制成的中药材料，但它们之间存在区别。同仁堂陈皮丝是以浙江产的陈皮为原料，经过切成丝状、晒干和蒸汽熨平等多道工序加工而成。而新会陈皮则是以广东新会产的陈皮为原料，经过晒干和揉捻成丝状制成。在制作过程中，同仁堂陈皮丝会添加其他中药材料，如枸杞和山楂等，以增强其功效。而新会陈皮则相对较为纯粹，只含有陈皮本身的药效。因此，选择哪种陈皮需要依据具体情况和需求进行选择。