1. 外形不同。新会陈皮是三瓣相连，片张分明，内囊朝上，呈现反转的形态；而川陈皮则形状不规则，有的是三瓣的，有的是四瓣的，甚至还有的是不规则的。
2. 表皮差异很大。新会陈皮因为是天然晒干的，所以褶皱十分明显，因为新会柑的特点，油点分布均匀而密集；而川陈皮则不同，它是采用三浸三晒的方法干制而成，没有明显的褶皱，光泽暗淡，油室较少，油点分布不均匀。广东陈皮都是三瓣相连的。
3. 内囊的差别也非常大。川陈皮的内囊颜色偏黄而厚实，看不见明显的圆形油点，有浮丝太多；而新会陈皮内囊为雪白或淡黄白色，海绵浮松状明显，有大小均匀的圆形油点。
4. 泡水喝的效果也不同。川陈皮具有橘子香气味，入口带痹、苦涩；而新会陈皮则味道有芳香柑果味，入口辛带甜。
这些是川陈皮和广东陈皮的最主要的区别。